以培养优秀的临床医生为目的，树立国际观（英语教学）、伦理观，提高沟通能力和自立意识。本系设置了高效的教育课程，旨在培养基础科学扎实的实干型综合临床医生。
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在各个领域进行2、3年的基础医学、3、4年的社会和临床医学方面的短期集中和反复学习，同时针对特定专题设置了横跨几个领域的基础临床教育科目，并在学期末通过综合考试对学习的掌握程度进行考评，在此基础上按年级做出升级考评。此外还有包括实验、实习和练习的多种自主学习形式的教学活动。
在毕业年级，通过海外临床实习、实践性强的参与型临床实习和综合讲学，争取成为拥有基本知识、医德、技能的综合临床医生。
专业：医学科。
医学系系主任：大村昭人
东京大学医学部毕业，医学博士。曾任美国华盛顿大学副教授。1979年到帝大工作，曾任帝大医学部附属溝口医院副院长。专攻麻醉学，曾任日本麻醉科学会理事，LSO专门委员会121国内委员长，日本医院协会、医疗税制委员会委员。日本工业标准调查会、医疗机械技术专业委员、临床工学技师国家级考试委员会的委员等。三学会共同呼吸疗法认定士认定委员会事务局长。
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